Flensborghus er i dag centrum for det danske kulturarbejde i Sydslesvig. Det huser så at sige »den danske centraladministration« i Sydslesvig. Flensborghus blev oprindelig opført som vajsenhus, det første danske vajsenhus uden for København. Bag opførelsen stod Maria Christina Lorck, der var inspireret af pietistiske stiftelser i Tyskland. Flensborghus blev opført med munkesten fra det nedrevede Duborg Slot. Fra 1760 blev en del af bygningen anvendt som tugthus og som kaserne for danske soldater. Efter det danske nederlag i 1864 kom Flensborghus under tysk miltærforvaltning, og efter 1894 blev det omdannet til hotel. Efter Første Verdenskrig blev der i i huset indrettet et dansk bibliotek (Flensborg Bogsamling) samt dansk forsamlingshus. Over indgangsportalen i Nørregade (Norderstrasse) ses Flensborgs byvåben i to sandstensrelieffer samt Frederik den Fjerdes monogram (Flensborghus blev opført med tilladelse fra Frederik den Fjerde). I Flensborghus' mødesal findes et dusin portrætter af sønderjyske personligheder malet af Harald Slott-Møller. Sydslesvigsk Vælgerforening, Sydslesvigsk Forening og Sydslesvigs danske Ungdomsforeninger har sekretariat i Flensborghus.