Mørkhøj kan ligesom de øvrige landsbyer i Gladsaxe Kommune spores tilbage til middelalderen. Omkring 1180 forærede Valdemar den Store Mørkhøjgård og Bagsværdgård til biskop Absalon i Roskilde. De fleste gårde blev drevet som landbrug, men f.eks. var ejerne af Mørkhøjgård typisk mænd udenfor bondestanden, der ansatte forpagtere til at drive gården, men i øvrigt selv havde borgerlige erhverv. Der var et par klædehandlere i blandt Mørkhøjgårds ejere, hvoraf Anders Andersen Kierkegaard var den mest kendte. Han købte en mindre grund til Mørkhøjgård, hvorpå han opførte en klædefabrik, der blev kaldt Enigheden. Fabrikken blev opført i 1809 og forsvandt igen i 1830’erne. Fabrikken satte sig spor langt frem i tiden i Mørkhøj, fordi den var årsag til at en vej blev benævnt Fabriksvej. Vejen hed Fabriksvej indtil 1909, hvorefter den blev en del af Gladsaxevej. Mørkhøjgård er fredet og fredning blev tinglyst 21.03.1950 iht. lov om bygningsfredning af 1918.03.12. Mørkhøjgård ejes i dag af Fødevarestyrelsen. Hovedbygningen og de dermed sammenbyggede sidefløje mod gården (1836). Adresse: Mørkhøj Bygade 19, 2860 Søborg